חיסור שברים עובד בדיוק כמו חיבור שברים מבחינת ההכנה: צריך מכנה זהה כדי לבצע את פעולת החיסור בין המונים. אם שני השברים כבר עם אותו מכנה, מחסרים את המונה של השבר השני מהמונה של השבר הראשון ומשאירים את המכנה. אם המכנים שונים, מוצאים מכנה משותף, מרחיבים כל שבר לאותו מכנה, ורק אז מחסרים מונים. בסיום מצמצמים את התוצאה כדי לקבל שבר מצומצם, ואם מתקבל שבר מדומה ניתן להציג אותו גם כמספר מעורב. במחשבון חיסור שברים אונליין מזינים שני שברים, לוחצים חישוב ומקבלים תשובה מצומצמת יחד עם הסבר שמקל להבין מכנה משותף, הרחבה וצמצום.